適時采收和認真細致地分級是提高真姬菇商品價值的重要環節。真姬菇長到一定標準時，即菌蓋1.5～4厘米時就應及時采收。采收時，一手按住菌柄基部培養料，一手握住菌柄，輕輕地將整叢菇擰下。第一潮菇采收完后，及時清除料面上殘留的菌柄、碎片和死菇，并進行補水管理。大約15天左右第二潮菇蕾就會形成，如前所述繼續管理，就可采收第3、4潮，有的可采收第5潮菇。
一般真姬菇可分為3個等級。一級菇，菌蓋直徑1.5～2.5厘米，菌柄長度4厘米以下；二級菇，菌蓋直徑2.6～3.5厘米，菌柄長4厘米以下；三級菇，菌蓋直徑3.6～4.5厘米，菌柄長4厘米以下。
