隨著食用菌生產的快速發展，不少生產者在從事菌類栽培的同時，也開始自己制作菌種。但由于技術和設備不到位，出現不少問題。在進行菌種生產過程中應注意以下幾個問題：

    一、引進母種"四要"。一是引種時一定要到正規、信得過的科研單位和菌種生產廠家引進，這樣菌種質量才有保障。二是要明確菌種的特征特性，掌握適宜出菇的溫度范圍，做到心中有數，適時投料播種。三是引進菌種后，一定要做出菇試驗，檢驗菌種的適應性，確保規模生產時萬無一失。四是有些品種在冰箱中保藏后，需轉管復壯后再擴接原種，否則，菌種很難成活。據試驗，雞腿菇、姬松茸、大球蓋菇、金針菇、木耳類等品種，均是經復壯后再擴接原種更為保險。

    二、培養料配方要科學合理。無論是生產原種還是栽培種，原輔料的比例一定要準確無誤，培養料的碳氮比值一定要合理，特別是要控制氮元素的比例不能超標。否則，裝瓶裝袋后游離氨在瓶內、袋內無法排除，菌絲將無法定植生長，導致菌種生產失敗。

    三、滅菌要徹底，接種應無菌。菌種培養基用常壓滅菌，應在100℃溫度下保持12—14個小時。高壓滅菌壓力達到1.5千克／平方厘米后要保持1.5小時以上。接種時，應嚴格按照無菌操作進行。

    四、發菌階段應控溫。高溫季節生產菌種，自然氣溫高，在常規條件下培養發菌，控制料溫升高是至關重要的一環。一是接種應在早晚溫度較低時進行。二是擺放菌種時，瓶與瓶或袋與袋之間均應留有一定的空隙，有利于熱量散發。如果瓶、袋緊靠，菌絲的呼吸熱不能得到有效散發，勢必導致高溫燒菌現象發生，菌絲生長發育受阻，稀疏無力，菌種質量將嚴格受損。三是培養室應選擇空氣對流、通風良好的房間，溫度高時，可隨時通風降溫。四是高溫季節瓶、袋上面切忌覆蓋，更不可堆碼過高，否則，對散熱極為不利。